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健康医学有关硕士论文范文 跟美国健康医学图书馆数据服务方面硕士论文范文

主题:健康医学论文写作 时间:2024-01-04

美国健康医学图书馆数据服务,该文是健康医学类有关毕业论文题目范文跟医学图书馆和数据服务和健康有关毕业论文题目范文.

健康医学论文参考文献:

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摘 要 文章选取美国10所开展科研数据服务的典型健康医学图书馆作为研究对象,以图书馆的网站为数据源,以健康医学科研项目工作流为主线,总结10所健康医学图书馆的数据服务内容,为国内健康医学图书馆开展数据服务提供借鉴.美国健康医学图书馆数据服务内容丰富,涉及科研项目的每个阶段;国内图书馆学科馆员应与科研人员建立紧密联系,提供嵌入健康医学科研项目工作流的数据服务.

关键词 健康医学图书馆 图书馆数据服务 学科馆员 科研项目工作流 美国

引用本文格式 陈秀娟,吴鸣. 美国健康医学图书馆数据服务[J]. 图书馆论坛,2016(10):114-120,封三.

Data Service of American Health and Medical Science Libraries

CHEN Xiu-juan,WU Ming

Abstract This paper studies 10 American health and medical science libraries which provide data services based on the information from their official websites. It analyses and summaries the contents of the libraries’ data services throughout the whole research project workflow,aiming to provide reference to develop data services in Chinese health and medical science libraries. American health and medical science libraries provide various data services throughout each stage of research project workflow. Chinese subject librarians should establish close contact with researchers and embed their data services in health and medical science research project workflow.

Keywords health and medical science;library data service;subject librarian;research project workflow

0 引言

科研数据的共享逐渐引起科学界以及各领域学术界的重视,越来越多的人开始关注数据密集型学科科研数据的管理和共享,如人文社科领域的社会学、经济学等学科的科研数据[1],自然科学领域的生物学、医学、地球科学和天文学、物理学、化学等学科的科研数据.其中,健康医学领域是科研数据管理和共享起源较早的领域;由于其科研数据的独特性和代表性及其对医学科研人员、医学工作者的科研和实践价值,也是备受关注的学科领域.医学领域的指导机构美国国立卫生研究院(National Institutes of Health,NIH)要求从2003年10月1日开始,所有向NIH申请项目(基础性研究、临床研究、调查研究及其他由NIH资助的研究项目)经费在500,000美元以上的科研人员都需要提交一份共享科研数据的计划,因特殊原因不能共享的应在文档中详细说明[2].英国医学研究理事会(Medical Research Council,MRC)要求所有的申请者提交的项目申请书都应包含一份数据管理计划,并附有模板介绍计划所包含的内容[3].此外,美国医疗保健研究与质量局(Agency for Healthcare Research and Quality,AHRQ)、美国疾病控制与预防中心(Centers for Disease Control and Prevention,CDC)、英国癌症研究协会(Cancer Research UK)、澳大利亚国家健康与医学研究理事会(Australian Government National Health and Medical Research Council,NHMRC)等健康医学机构也发布了数据共享政策.

为顺应科研数据共享的发展趋势、应对科研数据共享带来的机遇和挑战,国外很多健康医学图书馆开展了科研数据管理服务并已形成相当成熟的服务形式,立足满足处于科研一线的医学科研人员科研数据管理服务的需求.而国内无论是医学领域还是其他学科领域的科研数据的管理都尚处于探寻、摸索阶段,医学学科馆员急需国际上先进服务经验的指导.鉴于此,国内一些学者已经对国外健康医学科研数据管理服务进行了研究,如2014年,李芳薇等人分析了美国国立医学图书馆(The National Library of Medicine,NLM)生物医学学科馆员支持科研课题研究数据管理服务的模式、内容和效果,并探讨了国外生物医学数据管理服务对国内学科化服务的启示[4];2015年,李芳薇等人又对国外图书馆生物医学科研数据管理服务做了进一步的研究,调研了印第安纳大学图书馆和马萨诸塞大学医学院图书馆的科研数据服务模式并提出了我国图书馆科研数据服务模式的设想[5];2015年,唐源等人对国外典型的医学相关机构的科学数据共享政策进行了分析,提出我国政府应加大对医学科学数据共享的支持和引导,借鉴国外科学数据共享的政策体系,建立我国的医学科学数据共享政策[6].总体来看,这些仅仅是基于个案的研究,并没有对国外健康医学领域图书馆科研数据管理服务进行全面的调查,目前美国健康医学图书馆科研数据管理服务已经积累了丰富的资源和实践经验,是国际健康医学领域数据服务的良好标杆.为全方位了解国外健康医学图书馆科研数据管理服务发展的现状,本文选取美国10所开展科研数据服务的典型健康医学图书馆作为研究对象,并从科研项目工作流(见图1)的角度分析10所健康医学图书馆的数据服务内容,汲取其服务经验,以期为国内健康医学图书馆探索科研数据管理服务提供指导和借鉴.

1 研究对象及数据来源

1.1 研究对象

本文研究的美国健康医学图书馆主要参照北京大学医学图书馆给出的“国外医学图书馆导航”[7]中的38所健康医学图书馆列表,考虑到全面性和代表性,笔者又查阅了相关文献资料补充了25所健康医学图书馆,最终确定63所.通过网络调研对这些图书馆的数据管理服务情况进行扫描和分析,最终选取其中10所数据管理服务开展较好的美国健康医学图书馆作为本文的研究对象,见表1.

1.2 数据来源

本研究所用的数据和资料均来自10所健康医学图书馆的网站,调研截止日期为2016年1月8日.

2 美国健康医学图书馆科研数据服务内容

具体的科研数据服务与科研项目流息息相关,科研项目从启动、实施到结题的任何一个阶段,健康医学图书馆都提供了对应的数据服务,以帮助健康医学科研人员更好的管理和共享过程数据及成果数据.但不同图书馆由于目标定位不同,提供服务的侧重点存在差异.为清晰展示10所健康医学图书馆的服务,下文主要以健康医学科研项目工作流为主线,分析和总结他们所开展的对应项目启动前、项目进展中和项目结题后的数据服务.

2.1 提供项目启动前的健康医学科研数据管理计划服务

目前,科研数据管理计划(Data Management Plan,DMP)已经成为国外很多科研资助机构项目评审的一个必要条件,其列出了在项目进展中及项目结题后数据收集、数据组织、数据处理、数据存储、数据共享和数据复用的全过程,帮助科研人员识别和列出在整个科研过程中与科研数据管理相关的风险[8].但目前大部分健康医学科研人员数据素养匮乏,还不具备制定一份符合资助机构要求的数据管理计划的能力,鉴于此,很多健康医学图书馆提供了这项服务.调研的10所图书馆除华盛顿大学健康科学图书馆外,其他的9所图书馆均提供了数据管理计划服务,包括提供数据管理计划元素、模板、案例及推荐数据管理计划工具.

2.1.1 提供数据管理计划元素、模板或案例

数据管理计划元素、模板及案例展示了数据管理计划基本框架、格式及应包含的具体内容,可以帮助零基础的科研人员直观清晰的了解数据管理计划.由于不同科研资助机构对数据管理计划的内容要求不同,所以目前数据管理计划并无统一的形式.健康医学图书馆为用户提供了支持部分健康医学科研资助机构要求的数据管理计划元素、模板或案例,如匹兹堡大学健康科学图书馆制定了符合NIH基因数据共享政策的数据管理计划模板[9];部分图书馆在其数据服务网站上提供了美国国立卫生研究院发布的创建基因数据共享计划的指南,指南中详细说明了基因数据共享计划的元素包括数据类型、数据知识库、数据提交和发布的时间、基因数据共享计划的*审查委员会(Institutional Review Board,IRB)审查保证、数据的合理使用、数据提交的例外请求6项,此外,指南中还给出了人类基因研究和非人类基因研究数据共享计划的案例[10].还有一些图书馆链接了其他机构提供的学科通用的数据管理计划元素、模板或案例,如DCC的数据管理计划元素列表.

2.1.2 推荐数据管理计划创建工具

目前,没有专门针对学科领域开发的数据管理计划创建工具,健康医学图书馆多通过咨询、培训等方式给用户推荐可用的数据管理计划工具,如由美国加利福尼亚数字图书馆联合其他几个机构开发的DMPTool以及英国数字监管中心(Digital Curation Centre,DCC)开发的DMPonline是两种最常用的数据管理计划创建工具,其提供多种符合科研资助机构数据政策要求的模板,用户可根据需求选择对应的资助机构,依据指南创建数据管理计划.此外,工具还提供了个性化功能,用户可自己的数据管理计划模板和指南.除了两种业界比较推崇的工具,在笔者调研的过程中发现,健康医学图书馆还推荐了其他几种数据管理计划创建工具,如昆士兰大学开发的“Online Data Management Planning Tool”、悉尼大学开发的“Research Data Management Planning Tool”等,表2总结了健康医学图书馆推荐的5种数据管理计划创建工具,供科研人员参考使用.

2.2 提供支持项目实施的健康医学数据管理服务

项目进展过程中是整个科研过程数据输出的主要阶段,也是数据管理比较重要及数据管理活动较多的阶段,该阶段的任何一个问题都可能影响到最终科研成果的发表.调研的10所图书馆有美国国立卫生研究院图书馆、华盛顿大学健康医学图书馆等9所图书馆提供了支持科研项目实施的数据管理服务,包括健康医学数据发现与收集、健康医学数据组织、健康医学数据分析、健康医学数据存储与备份(见表3).

2.2.1 健康医学数据发现与收集服务

科研项目开始之初,科研人员首先需检索目前是否存在与即将进行的项目相关的数据,以及这些数据是否可以在项目中再次使用.部分健康医学图书馆对常见的数据类型进行了介绍并给出了获取它们的途径,如对于大多数健康和医学研究来说,临床数据是一种主要的资源,华盛顿大学健康科学图书馆介绍了电子病历、管理性数据、索赔数据、疾病登记数据、健康调查数据、临床试验数据并提供了查找它们的方法.在正式进入项目数据的收集时,科研人员需根据项目即将产生的数据类型选择合适的数据收集工具,健康医学图书馆为其提供了可供选择的数据收集工具.

2.2.2 健康医学数据组织服务

数据组织使无序的数据转化成更加有序的数据,有效的数据组织有利于数据的保存、检索和发现.健康医学图书馆为帮助科研人员更好地组织数据,通过文件命名、版本控制的方式来确保数据文件的完整性和有效性,如为科研人员介绍一些文件命名规则、文件命名工具[Bulk Rename Utility(Windows)、Renamer(Mac)、PSRenamer]、版本控制工具(CVS、Subversion、Bazaar)等.通过给科研人员推荐健康医学领域常用的元数据、分类表和本体,实现科研数据未来可获取和可理解,推荐的常见健康医学元数据包括:NIH通用数据元素(Common Data Elements,CDE)、基因元数据标准PATRIC、Darwin Core等;分类表包括:医学主题词表(Medical Subject Headings,MeSH)、国际疾病分类表(International Classification of Diseases,ICD);健康医学本体有Gene Ontology.

2.2.3 健康医学数据分析服务

科研数据的分析主要是对科研项目的原始数据通过一些工具和方法进行处理得到最终数据.健康医学图书馆在数据分析方面所提供的服务主要体现在两个方面:(1)学科馆员利用专业技能帮助有需求的科研人员进行数据分析;(2)学科馆员根据科研人员所提供的数据类型为他们推荐合适的数据分析工具,如健康指标和评估研究所(Institute for Health Metrics and Evaluation)开发的交互式数据可视化工具IHME Data Visualization Tools;用于识别生物医学研究、生命科学研究、科研人员相互之间的关系连接并对这些连接进行可视化的Web应用程序KNALIJ for Pubmed等,还有一些数据预处理以及通用的数据分析工具.但总的来说,推荐数据分析工具是目前较为常见的一种服务方式.

2.2.4 健康医学数据存储与备份服务

良好的存储和备份策略可以确保数据的可获取性不随时间变化而变化,并且协助科研人员预防意外的或恶意的数据丢失.多数健康医学图书馆为科研人员提供了数据存储和备份服务,包括提供数据存储和备份的指南或小贴士及推荐数据存储和备份方式、工具等.笔者对表3中的9所图书馆推荐的存储和备份方式及它们的优缺点进行了总结和分析(见表4),科研人员可以根据项目不同的情况选择合适的存储和备份方式.除了提供了存储和备份的方式之外,图书馆还推荐了健康医学数据存储和备份的工具,如SmartCopy.

2.3 提供项目结题后的健康医学数据

健康医学科研项目结束后,根据数据的类型、特点和价值,科研人员可能会将项目的原始数据作不同的处理,比如项目过程中产生的涉及病人隐私的临床数据,这些数据是不宜公开的,科研人员一般将其在内部保存;对于那些可以公开共享的数据,目前主要存在3种发表方式:(1)数据仓储发表:在遵循版权协议的情况下,将数据直接存储到数据仓储(Data Repository)中;(2)学术期刊发表:作为支撑论文内容的材料;(3)数据期刊发表:主要对科研数据集进行描述,以论文形式发表,原始数据提交到推荐的数据仓储中[11].健康医学科研数据的发表是项目产生的数据得以共享的主要途径,但科研数据发表作为一种新的科研成果发表方式,大部分科研人员对其较为陌生.为解决科研人员在科研数据发表过程中的问题,健康医学图书馆提供了针对三种数据发表方式的数据服务.调研的10所图书馆除美国国立卫生研究院图书馆外,其他9所图书馆都提供了数据发表相关的服务,服务情况见表5.

2.3.1 提供健康医学数据仓储

将健康医学科研项目产生的数据独立存储在数据仓储中是数据共享的主要方式,但科研人员在选择这种方式共享数据时难免会遇到各种挑战,如健康医学数据仓储种类繁多,质量参差不齐,给科研人员选择合适的数据仓储增加了难度;而且医学科研数据类型复杂多样,而不同的数据仓储对内容、格式等的要求没有统一的标准,增加了科研人员的工作压力[12].健康医学图书馆主要通过三种方式协助科研人员将数据发表在数据仓储中:(1)图书馆自建健康医学数据仓储库,如马萨诸塞大学医学院Lamar Soutter图书馆创建了eScholarship@UMMS管理平台,实现科研项目的知识和资源的收集、组织、长期保存、共享和发现;(2)图书馆提供查找权威认证的健康医学数据仓储的目录和列表,如比较知名的re3data.org[13]、OAD[14]数据仓储注册和目录系统,通过它们可以快速查找符合要求的数据仓储,此外部分图书馆还提供了专门针对健康医学的数据仓储目录,如NIH数据共享仓储目录(NIH Data Sharing Repositories)[15]、PLOS推荐的数据仓储的目录(PLOS Recommended Repositories)[16]等;(3)图书馆提供健康医学数据仓储列表,大部分健康医学图书馆都在其图书馆数据服务的网站上提供了一些常见的健康医学数据仓储的列表及介绍,如HealthData.gov、Clinical Trials、Global Health Observatory Data Repository等.

2.3.2 提供健康医学学术期刊

数据同出版物一起发表,主要以两种形式存在,一种是论文发表时把相关数据提交到数据仓储中,通过数据唯一标识符与论文关联;另一种是数据作为论文的补充材料同论文一并提交.目前很多健康医学领域的出版商和期刊制定了数据共享政策,且将其作为论文发表的必要条件,如PLOS提出为最大程度地推动科学进步,在符合法律及*的情况下,文章所用的数据应当向其他科研人员免费开放[17].科研人员在项目进行的过程中,如果不了解期刊的数据政策,很难做到妥善完整地保存相关数据,阻碍最终科研成果的发表.针对科研人员将支撑科研成果的数据发表情况,健康医学图书馆提供了咨询、培训等服务.马萨诸塞大学医学院Lamar Soutter图书馆总结了马萨诸塞大学医学院科研人员发文最多的10种学术期刊及其数据政策[18],确保科研人员在论文发表之前就对期刊数据政策有所了解,提前为科研成果的发表及相关支撑数据的共享做好准备.

2.3.3 提供健康医学数据期刊

数据期刊多出版专门针对科研数据的数据文章(Data Paper) ,通常只对科研数据的题名、日期、作者、摘 要、永久识别符、存档资源的链接或者实验条件、设施、环境要求等元素进行描述,而不是以科研数据的详细分析为内容[19],其是数据共享环境下出现的一种不同于普通科研成果发表的新的学术出版形式.目前已有很多学科推出了数据期刊,2014年,Leonardo Candela等人对目前出现的数据期刊进行调查,研究了15个不同期刊出版商创办的116种数据期刊,其中生物医学领域的数据期刊有85种(部分为兼发学术论文和数据论文的期刊)[20],如Open Health Data(Ubiquity Press)、GigaScience (BioMed Central)、BioMedical Data Journal(Procon Ltd.)等.由此可见,健康医学领域的数据期刊在所有学科领域的占比是最多的,健康医学科研人员发表数据论文相对于其他学科领域更加广泛.在调研的过程中发现,健康医学图书馆在数据论文的发表方面主要起的是咨询、推荐的作用,但目前提供服务的图书馆较少,10所图书馆仅马萨诸塞大学医学院Lamar Soutter图书馆、匹兹堡大学健康科学图书馆、纽约大学健康科学图书馆3所图书馆提供了数据期刊.

3 启示

3.1 学科馆员应嵌入健康医学科研项目工作流

从本文的调研结果可知,健康医学科研工作流的每个阶段图书馆都提供了相应的数据服务,健康医学图书馆学科馆员在为科研人员提供数据服务时,应“融入一线,嵌入流程”,紧密结合项目工作流,满足科研人员对科研项目不同阶段的科研数据服务的需求.笔者结合10所健康医学图书馆提供数据服务的情况,总结了我国健康医学图书馆可提供的嵌入健康医学科研工作流的数据服务.图书馆可通过咨询、培训课程等方式提供贯穿健康医学科研工作流的数据服务,具体服务内容见图2.

3.2 学科馆员应与科研人员协作

在调研的过程中,笔者还发现,多数健康医学图书馆都是单方面的提倡数据服务,那么健康医学学科馆员为科研人员提供面向科研项目的数据服务时,可能存在如下两方面的问题:(1)学科馆员在学科领域知识或专业技能方面有所欠缺;(2)学科馆员不了解科研人员项目的具体情况.因此,健康医学学科馆员若要提供契合科研人员需求的数据服务,不仅需要了解项目的科研流程,而且需要与科研人员建立紧密的联系,成为科研过程密切的合作者.在合作过程中,学科馆员可以及时发现自身不足并进行相应的学习,一方面,学科馆员深入到科研人员的研究环境中,扩大整个健康医学科研工作流管理的视角;另一方面,学科馆员与科研人员协作也潜移默化的影响了科研人员的数据管理意识和数据管理技能,进一步推动了学科馆员提供数据服务的进程.

4 结语

科研数据服务是图书馆嵌入式学科化服务的进一步拓展,是图书馆服务的一个重要发展方向,数据密集型的健康医学领域加入到数据管理和共享的行列中更是必然趋势,其需要健康医学图书馆数据服务的支持.国内健康医学图书馆应吸取美国图书馆数据服务的经验,加快国内健康医学数据服务的步伐.具有数据检索、数据组织、数据分析等专业优势的健康医学学科馆员,还必须具备足够的学科领域专业知识,真正融入到科研人员的研究工作中,从科研工作流的视角提供满足科研人员实际需求的数据服务.

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作者简介 陈秀娟,女,中国科学院大学、中国科学院成都文献情报中心博士研究生;吴鸣,女,硕士,研究馆员,中国科学院文献情报中心学科咨询服务部主任.

收稿日期 2016-03-29

(责任编辑:邝玥)

综上资料,上文是关于医学图书馆和数据服务和健康方面的相关大学硕士和健康医学本科毕业论文以及相关健康医学论文开题报告范文和职称论文写作参考文献资料.

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